Dersin Bilgileri

Dersin Adı	Türkçe	Yapısal Biyo.Biliş.Uygulam.
	İngilizce	Applied informatics in structural biology
Dersin Kodu	BLU 532	Kredi	Ders (saat/hafta)	Uygulama (saat/hafta)	Labratuvar (saat/hafta)
Dönem	-	3	3	-	-
Dersin Dili		Türkçe
Dersin Koordinatörü		Vildan Enisoğlu Atalay
Dersin Amaçları		1) Biyolojik olayların yapısal temellerinin tanıtılması 2) Yapısal biyoloji ile ilgili verilerin türleri, gösterimi, görselleştirilmesi ve kaynaklarının tanıtılması 3) Biyolojik makromoleküllerin yapı ve dizileriyle ilgili bilişim uygulamalarının tanıtılması 4) Dizi-yapı-fonksiyon ilişkilerini analiz eden metotların tanıtılması
Dersin Tanımı		Yapısal biyoinformatik, Protein, DNA ve RNA yapıları, Yapı-tabanlı biyolojik veri tabanları ve çevirim içi servisler, Biyomoleküllerin görselleştirilmesi, Dizi hizalandırmaları, Yapı hizalandırmaları ve sınıflandırılması, Protein iki ve üç-boyutlu yapı modellemesi, Nükleik asit iki ve üç boyutlu yapı modellemesi, Protein-protein etkileşimi modellemesi, Membran proteinleri için yapısal biyoinformatik
Dersin Çıktıları		1) Protein ve nükleik asitlerin yapılarının temel prensipleri 2) Yapısal biyoloji için veri tabanları ve çevirim içi araçlar 3) Yapısal verilerin görselleştirilmesi ve gösterimi 4) Protein yapısı modelleme ve tahmini 5) Nükleik asit yapsı modelleme ve tahmini 6) Makromoleküllerin fonksiyonel ve yapısal analizleri 7) hakkında bilgi sahibi olacaklardır.
Önkoşullar
Gereken Olanaklar
Diğer
Ders Kitabı		1) Gu, J and Bourne, P.E; Structural Bioinformatics, Wiley, 2009 2) Frishman, D; Structural Bioinformatics of Membrane Proteins, Springer, 2010 3) Leontis, N and Westhof, E; RNA 3D Structure Analysis and Prediction, Springer, 2012 4) Peitsch, M.C., and Schwede, T; Computational Structural Biology: Methods and Applications, World Scientific 5) Forbes J. Burkowski, Structural Bioinformatics: An Algorithmic Approach, 2008, Chapman and Hall/CRC
Diğer Referanslar

Dersler

Yardım

Hakkında