BLU 532E - Yapısal biyolojide bilişim uygulamaları

Dersin Amaçları

1) Biyolojik olayların yapısal temellerinin tanıtılması
2) Yapısal biyoloji ile ilgili verilerin türleri, gösterimi, görselleştirilmesi ve kaynaklarının
tanıtılması
3) Biyolojik makromoleküllerin yapı ve dizileriyle ilgili bilişim uygulamalarının tanıtılması
4) Dizi-yapı-fonksiyon ilişkilerini analiz eden metotların tanıtılması

Dersin Tanımı

Yapısal biyoinformatik, Protein, DNA ve RNA yapıları, Yapı-tabanlı biyolojik veri tabanları ve çevirim içi servisler, Biyomoleküllerin görselleştirilmesi, Dizi hizalandırmaları, Yapı hizalandırmaları ve sınıflandırılması, Protein iki ve üç-boyutlu yapı modellemesi, Nükleik asit iki ve üç boyutlu yapı modellemesi, Protein-protein etkileşimi modellemesi, Membran proteinleri için yapısal biyoinformatik