Fakültede çağdaş standartlarla yapılmış ve yeterli ekipmanlarla donatılmış öğrenciye yönelik 12 adet fizik, kimya ve moleküler biyoloji laboratuarları ve çok sayıda araştırma laboratuarları bulunmaktadır. 2002 yılında açılan ve dünya üzerinde sadece iki örneği bulunan ICFA-İstanbul Merkezi Fizik Bölümünde araştırmacılara hizmet vermektedir.